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炎癥性腸病包括克羅恩病和潰瘍性結腸炎，是由于免疫系統過度活躍造成消化道炎癥所致，可抑制免疫系統的藥物被用于幫助控制疾病。硫唑嘌呤是一種常用的治療炎癥性腸病的免疫抑制劑。
如果您的醫生建議開始使用硫唑嘌呤，可能意味著您的疾病需要通過硫唑嘌呤來維持緩解、您對激素依賴無法停藥、或激素治療無效、或者在類克治療過程中聯合用藥提高療效。目的是使您的炎癥性腸病得到緩解。
1.對硫唑嘌呤過敏；
2.嚴重的感染，包括活動性病毒性肝炎；
3.結核；
4.肝功能嚴重受損或嚴重的骨髓造血功能障礙，嚴重的腎臟疾病；
5.未經治療的惡性病；
6.既往有胰腺炎病史，或當前患有胰腺炎；
7.在過去四周內曾接種活疫苗（如卡介苗、黃熱病疫苗、水痘疫苗等）；
8.懷孕和哺乳期，請具體咨詢您的醫生。
1.骨髓抑制（白細胞減少，粒細胞缺乏，血小板減少，全血細胞減少）。
最常見的副作用是降低白細胞。可能只需要稍微調整一下您的用藥劑量就能解決這個問題。由于這些藥物會使您的白細胞降低，我們需要密切地監測您的白細胞量的變化。這些藥物也會使您的紅細胞和血小板計數降低。所以一旦開始治療，血常規檢查需要在開始用藥后的1周或者每次藥物劑量調整后進行檢測。您的白細胞可能低到有感染的風險，甚至危及生命。
發生重度白細胞減少癥（<1000/mm3）或粒細胞缺乏癥（<500/mm3）時可能表現為：身體感到不舒服；通常會發高燒或寒顫；扁桃體發炎；口炎；淋巴結腫大；頭痛；惡心；咳嗽；外陰炎和肛門炎癥。
2.惡心，嘔吐，上腹痛。有時候，在服藥時您可能會有些惡心或胃口不好。可能需要一段時間的適應期，很快就能好轉。如果出現了惡心，那么在晚上臨睡前吃藥可能會有幫助。
3.因硫唑嘌呤抑制機體防御反應，加之基礎病（如本身有潛伏結核）等因素的影響，造成機體對多種病原體的抵抗能力下降。很易造成各種感染，患者感染的現象會明顯增多，特別是結核，肝炎等細菌病毒感染。
4.胰腺炎，是最嚴重的副作用，但也是很少發生的副作用。大約5%的患者會發生。通常會在開始用藥后不久就發生。胰腺炎的癥狀是惡心、嘔吐、上腹和/或后背痛。也有可能沒有癥狀，僅血液監測時發現脂肪酶/淀粉酶升高。一旦您出現了這些情況，請盡快告訴醫生。通常停藥之后胰腺炎就會好轉，但一旦您發生胰腺炎，可能意味著您不能夠再次使用硫唑嘌呤。
5.肝臟損傷：肝中毒；膽汁淤積性黃疸；結節再生性增生；紫癜。硫唑嘌呤通過肝臟分解代謝，因此監測肝功能的血液檢查也非常重要，可以與其他血液檢查同時進行。有時候您的肝臟不負重擔，您可能在進行血液檢查前都不會發現。很少見的情況下，您的皮膚或眼白可能會發黃（黃疸）。這種情況通常通過調整藥物劑量能夠改善。但是需要密切監測肝功能直到恢復正常。
6.少見副作用有超敏反應（主要表現有高熱和全身不適）、斑丘疹、血管炎、關節痛、肌痛等。
7.腫瘤風險。硫唑嘌呤在抗排異和化療時大劑量的使用被發現是可以導致腫瘤的，但由于在IBD中使用的劑量非常小，腫瘤的風險也非常低。
8.其它不可預知的副作用