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3-羥基己酸甲酯為羥基脂肪酸低級烷基酯，是組成聚羥基脂肪酸酯的單體之一，可作為燃料使用。聚羥基脂肪酸酯(Polyhydroxyalkanoates，PHA)是微生物在生長不平衡的環境下積累的能源和碳源貯藏物。組成PHA的單體多種多樣，截至目前，已發現組成PHA的單體有100多種。
以微生物合成的PHA作為來源的各種羥基脂肪酸低級烷基酯作為燃料可以豐富目前的生物燃料領域，同時具有良好的社會和經濟效益。這些羥基脂肪酸低級烷基酯(例如甲酯或乙酯)作為燃料具有合適的燃燒熱、零污染物排放、可以和通用燃料例如汽油等混合使用、同時可以改善汽油等燃料的燃燒、提高其辛烷值等效果。作為燃料使用的羥基脂肪酸低級烷基酯具體包括但不限于3-羥基丁酸甲酯、4-羥基丁酸甲酯、3-羥基丁酸乙酯、3-羥基丁酸甲酯或乙酯和3-羥基戊酸甲酯或乙酯的各種摩爾比例的混合物、3-羥基丁酸甲酯或乙酯和3-羥基己酸甲酯或乙酯的各種摩爾比例的混合物、3-羥基中長鏈脂肪酸甲酯或乙酯的混合物、3-羥基丁酸甲酯或乙酯和4-羥基丁酸甲酯或乙酯的各種摩爾比例的混合物、3-羥基丙酸甲酯或乙酯、2-羥基丙酸甲酯或乙酯等。
此外，3-羥基丁酸及其衍生物如3-羥基己酸甲酯容易被人體吸收，安全劑量高，沒有顯著的毒副作用，可以有效抵抗腸道慢性的炎癥，非常合適作為慢性炎癥導致的癌癥患者作為長期服用的輔助性藥物。
[1]CN200810098735.7羥基脂肪酸衍生物作為燃料添加劑的應用
[2]CN201910160165.83-羥基丁酸及其衍生物在制備防治結腸炎、結腸癌的產品中的應用