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氯己烷主要用作醫藥合成中間體和有機合成中間體，主要用于實驗室研發過程和化工醫藥合成過程中。
氯己烷應用舉例如下：
1）制備雷莫司瓊：包括以下步驟：(1)將1-氯己烷、N-甲基吲哚和三氟乙酸三者混合，加熱攪拌制成混合溶液，然后加入R-4，5，6，7-四氫-1H-苯并咪挫-5-甲酸酐，升溫回流反應6-8h，降至室溫，得到混合產物；(2)將步驟(1)制備的混合產物先加入水，攪拌分層，取水相，用1-氯乙烷洗滌水相，調節溶液PH值，攪拌靜置分層，再加入甲醇合并有機相，經過濾干燥得到白色粉末，即雷莫司瓊。本發明的生產方法通過一步法制備工藝，降低了中間體純化帶來的困難，減少了副反應的發生，提高了收益率，而且生產方法操作簡便，便于工業化生產，且成本降低，有利于市場推廣。
2）合成乙烯基含氯硅烷，其步驟是：A.催化劑為醚做溶劑，二苯并吡啶或咔唑作配位體與氯鉑酸反應生成鉑的絡合物；B.用泵將含有催化劑的溶劑從反應釜底部輸送到反應塔頂，在反應塔釜內循環；C.在反應塔內裝陶瓷填料，將氣化后的含氫氯硅烷和乙炔混合物連續輸入反應塔內，讓其和催化劑在填料塔表面反應，連續進料反應；D.在0.001-0.3MPa壓力和50-90℃溫度下，用鉑絡合物做催化劑，用氯己烷做溶劑合成乙烯基氯硅烷。本發明方法簡便，操作容易，乙烯基含氯硅烷選擇性大于97.0%，不用回收乙炔，方法簡單，反應平穩易控。
[1] CN201610112860.3一種高收率的雷莫司瓊的生產方法
[2] CN200710168341.X一種合成乙烯基含氯硅烷的方法